土壤蛋白质组学是研究土壤环境中蛋白质组成、结构及其功能的科学领域。作为蛋白质组学与土壤科学交叉的前沿学科，土壤蛋白质组学主要关注土壤微生物及植物根际分泌蛋白的动态变化，目的是揭示土壤养分循环、微生物生态功能及环境污染修复等过程的分子机制。土壤作为地球上最复杂的生态系统之一，包含多种微生物、植物根系分泌物及有机物分解产物。土壤蛋白质组学的研究成果在多个领域具有重要应用价值。在农业科学中，该技术可用于解析植物根际微生物群落的功能变化，筛选有助于作物生长的有益蛋白，为生物肥料的开发提供科学依据。在环境科学领域，这项蛋白质组学技术能够揭示污染土壤中微生物群落对重金属、农药等污染物的降解机制，为污染修复提供分子靶标。此外，在全球气候变化研究中，土壤蛋白质组学可用于分析土壤微生物在碳循环中的作用，帮助优化农业管理策略以降低温室气体排放。随着多组学整合技术的发展，土壤蛋白质组学与转录组学、代谢组学等数据的结合将进一步深化对土壤生态系统的理解，助力精准农业及环境可持续发展。

土壤蛋白质组学的研究流程通常包括样本采集、蛋白提取与分离、质谱检测及数据分析等核心步骤。首先，研究人员根据实验目标选择不同类型的土壤样本，如农田土壤、森林土壤、污染土壤等，并采用适当的预处理方法去除大颗粒杂质，提高蛋白质回收率。在蛋白质提取阶段，研究人员常用界面活性剂、酶解或有机溶剂进行裂解以释放结合在土壤颗粒上的蛋白质。随后，利用LC-MS/MS等高灵敏度质谱技术进行蛋白质鉴定并结合功能数据库进行蛋白功能注释，以解析土壤生态过程中的关键蛋白网络。

土壤蛋白质组学的研究依赖于多种先进的技术方法。首先，样本制备是关键环节。由于土壤环境的复杂性，土壤蛋白的提取难度较大，研究人员通常采用超声波裂解、离心分离及化学试剂处理等方法以提高蛋白质回收率。随后，蛋白质分离技术如一维或二维凝胶电泳（1D/2D-PAGE）、液相色谱（LC）等被用于减少样本的复杂性，提高蛋白质的鉴定率。在蛋白质鉴定阶段，土壤蛋白质组学主要依赖高分辨率质谱技术，如液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）等，这些技术能够高效鉴定土壤中的蛋白质种类并解析其来源。最终研究人员通过生物信息学工具对蛋白质数据进行功能注释，以揭示蛋白质的生物学作用及其生态意义。

尽管土壤蛋白质组学技术不断进步，但其研究仍然面临诸多挑战。首先，土壤环境的复杂性使得蛋白质提取难度较大，土壤中含有大量的腐殖质、多糖和矿物颗粒，这些成分可能干扰蛋白的分离与质谱检测，导致低丰度蛋白难以被精准鉴定。其次，土壤蛋白质的来源多样，包括活细胞、死亡微生物的残留蛋白、外源污染蛋白等，如何区分功能性蛋白与无活性的环境蛋白是土壤蛋白质组学研究的课题。此外，由于土壤微生物多样性极高而现有的微生物蛋白数据库仍较为有限，导致某些未知蛋白的功能注释困难，这在非模式土壤微生物研究中尤为突出。

百泰派克生物科技凭借先进的质谱分析平台和专业的生物信息学团队，为科研机构及企业提供高质量的蛋白质组学研究服务。我们能够精准解析土壤样本中的蛋白质组成，助力研究人员探索土壤微生物生态功能及污染修复机制。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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